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Table 2 Amino acid residues in conserved motifs of Kolobok transposase

From: Multiple massive domestication and recent amplification of Kolobok superfamily transposons in the clawed frog Xenopus

Name DDE H2CH C2CH PWF AVPTIF Conservation
Tr1 DDE HHCH CCCH PWF SIPTQF  
Tr2 DDE HHCH YCCH PWF AIPSVF  
Tr3 DGD HHCH --CP PLL ALQ-LM  
Tr4 DNK HHCQ CCCH PWF ATPTLF  
Tr5 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr6 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr7 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr8 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr9 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr10 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr11 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr12 DDE HHCH CCCH PWF ATPTSF  
Tr13 DDE HHCH CCCH PWF AIPTLF +
Tr14 DDE HHCH CCCH PWF AIPTLF +
Tr15 DDE HHCH CCCH PWF AIPTLF +
Tr16 DDK HHCH CCCH PWF AIPTIF  
Tr17 DED HHCH CCCH PWF AVPTQF  
Tr18 DDE HHCH CCCH PWF AVPTVF +
Tr19 DGE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Tr20 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr21 DDE HHCH CCCH PWF AVPTLF +
Tr22 DDE HHCH CCCH PWF AVPTLF +
Tr23 DDE HHCH CCCH PWF AVPTLF +
Tr24 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr25 DDE HHCH -VCH PWF AVPTIF  
Tr26 DDV HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Tr27 DDE HHCH CCCH PWF AMPTQF  
Tr28 GDE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Tr29 GNE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Tr30 DDL HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Tr31 DDL HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Tr32 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Tr33 NDT HDCN CCCH PWF ALPTIF  
Tr34 DEE HHCH --T- P-- TEPVVV  
Tr35 DDE HHCH S-C- P-- –  
Tr36 DD- HHCH CCCH PWF AVPTIY  
Tr37 DDE YHCH -SC- S-F ---T--  
Tr38 DED HHCH Y-CK --L SLSTLL  
Lv1 DDE HHCH CCCH PWF AVPSIF +
Lv2 DED HHCH CCCH PWF AVPTLF  
Lv3 DDE HHCH CCCH PWF AIPSIF +
Lv4 DDE HHCH CCCH PWF AIPTIF +
Lv5 DDK HHCH CCCH PWF AFPTLF  
Lv6 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Lv7 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Lv8 DDE HHCH CCCH PWF AVPTIF ++
Lv9 DNK RHCH CCCH PWF ATPTLF  
Lv10 HDN HHCH CCCH PWF AIPTIF  
Lv11 DDQ HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv12 YNE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv13 DDK HNCH CCCH PWF ALPSIF  
Lv14 GDE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv15 DEE HHCH CCCH PWF AIPTIF  
Lv16 DSE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv17 DDQ HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv18 DDE HHCH CCCH PWF AVPTVF +
Lv19 DDL HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv20 GDE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv21 GDE HHCH CCCH PWF AVPTIF  
Lv22 GDE HHCH CCCH PWF AIPTIF  
Lv23 DDP HHCH CCCH PWF AVPTLF  
Lv24 DDK HHCH CCCH PWF AVPTIF  
  1. The “++” in the “Conservation” column indicates that all motifs are conserved. The “+” in the same column indicates that all motifs are conserved except for substitutions of similar amino acids in the AVPTIF motif
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Zoological Letters

ISSN: 2056-306X

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